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GNOME起動時(ログイン時)に自動的に起動するプログラムの設定、またはGNOME終了時(ログアウト時)に実行中のアプリケーションを記憶するための設定を行うには、システムメニューから、設定 ▸ ユーザ向け ▸ 自動起動するアプリを選択します。
ログイン時に自動的に起動するプログラムの設定は、自動起動するプログラムタブの画面にて行います。

例えば、ログイン後に不要なプログラムを起動させたくない場合は、自動起動するプログラムタブより、対象となるプログラムの左側にあるチェックを外してください。
自動起動するプログラムタブにて一覧に表示されているプログラムのうち、インストール時から存在する項目は削除ボタンにて削除しないでください。
一度削除すると、復旧するのが困難になります。
また、ログアウト時に起動していたアプリケーションを記憶させるようにするには、オプションタブで「ログアウト時に実行中のアプリを自動的に記憶しておく」にチェックを入れてください。ログアウト時に起動していたアプリケーションが記憶され、次回ログイン時に記憶していたアプリケーションが起動します。

アプリケーションによっては、ログアウト時に起動されていても次回ログイン時に起動しない場合があります。